农贸市场作为一个具有特定功能的场所，其定位和规划需要充分考虑市场需求、居民消费习惯以及城市发展等因素，因此，农贸市场提升改造方案在实施过程中确实会遇到不少难点，其中三大主要难点可以归纳为：

一、市场定位和规划难点

农贸市场提升改造方案中，如何在有限的空间内合理布局摊位、通道、停车场等设施，同时保证市场的通透性和舒适度是一大难点。具体来说，农贸市场改造设计过程中，需要应对市场定位等难点。市场定位不清晰，可能导致改造后的市场无法准确满足消费者需求，进而影响市场的经营效益。规划不合理可能导致市场内部布局混乱，摊位设置不合理，通道狭窄，影响消费者的购物体验和市场的运营效率。

二、设施升级和技术应用难题

农贸市场改造设计需要与时俱进引入先进的设施和技术，以提升市场的运营效率和环保水平。然而，这些设施和技术的应用需要投入大量资金，并且需要考虑其与现有市场的兼容性和可持续性。这包括：智能支付系统、冷链物流设备、环保材料等先进设施的引入，需要投入大量资金，并且需要考虑其运营成本和维护成本。技术应用需要与现有市场的经营模式和消费者习惯相适应，否则可能导致技术资源浪费或市场接受度低。

三、市场管理和运营难点

农贸市场改造设计完成后，如何进行有效的市场管理和运营是关键。市场需要建立健全的管理制度和规范，加强对商户的监管和培训，确保市场秩序井然、质量可靠。同时，市场还需要探索创新的运营模式和服务方式，以吸引更多的消费者和商户。例如：管理制度不健全可能导致市场秩序混乱，存在食品安全、卫生等问题，影响市场的声誉和消费者的信任度。

运营模式和服务方式创新不足可能导致市场竞争力下降，无法吸引更多的消费者和商户入驻。

综上所述，农贸市场提升改造方案在实施过程中需要充分考虑市场定位和规划、设施升级和技术应用以及市场管理和运营这三大难点。通过充分调研和规划、引入先进技术和设备、加强市场管理和运营等措施，可以打造出一个既满足市场需求又符合现代城市形象的农贸市场。